L’École nationale des chartes propose un doctorat, délivré par l’Université PSL, dans ses disciplines d'excellence : histoire, histoire de l’art, langues et littératures anciennes et romanes. Son recrutement est ouvert à ses diplômés (diplôme d'archiviste paléographe, master), comme à des étudiants venus d’autres établissements, et notamment de l’étranger. L’École des chartes propose un dispositif doctoral particulier, sur travaux, pour les conservateurs du patrimoine et les conservateurs des bibliothèques français, comme pour leurs collègues étrangers.